Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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