Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sf3b1Q99NB9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sf3b1Q99NB9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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