Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel1Q99MW3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms