Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms