Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrrtQ99MR6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms