Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms