Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms