Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms