Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms