Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps3Q91VB4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms