Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
GcaQ8VC88 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms