Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms