Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp45Q8K387 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp45Q8K387 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms