Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem17Q8K0U3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem17Q8K0U3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem17Q8K0U3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem17Q8K0U3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem17Q8K0U3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem17Q8K0U3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem17Q8K0U3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem17Q8K0U3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms