Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms