Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hpf1Q8CFE2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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