Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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