Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms