Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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