Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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