Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms