Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms