Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik4Q8BMF5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik4Q8BMF5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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