Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Atg4dQ8BGV9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg4dQ8BGV9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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