Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms