Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SnupnQ80W37 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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