Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc29Q80VM3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc29Q80VM3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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