Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rpp38Q80UU2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rpp38Q80UU2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rpp38Q80UU2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rpp38Q80UU2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rpp38Q80UU2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rpp38Q80UU2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rpp38Q80UU2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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