Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms