Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms