Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms