Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mindy1Q76LS9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mindy1Q76LS9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms