Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms