Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SpopQ6ZWS8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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