Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms