Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim37Q6PCX9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Trim37Q6PCX9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim37Q6PCX9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms