Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Atg9bQ6EBV9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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