Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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