Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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