Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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