Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln3Q61124 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cln3Q61124 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms