Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms