Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Grik1Q60934 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms