Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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