Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms