Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms