Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms