Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms