Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms