Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KhsrpQ3U0V1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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